来宝网 2013/10/14点击1619次
随着高通量测序技术的飞速发展，越来越多物种的基因组信息得到全面了解，这为更多的学者们研究相同物种不同个体间的基因变异提供了便捷。对已知序列的微生物基因组进行重测序，通过序列比对，可以进行个体或群体间的差异分析，找到大量的SNPs（单核苷酸多态性位点），InDel（插入缺失位点Insertion & Deletion）、SV（结构变异位点Structure Variation），具有深远的临床意义。
南京普东兴生物科技有限公司针对不同需求的合作伙伴，制定了研究方向，选择不同的测序深度，可以进行三种类型的细菌基因组测序，包括微生物基因组框架图，精细图，完成图；可以灵活选择测序方案，构建真菌基因组精细图。
图 细菌基因组圈图及COG分析
样本接收：
一、基因组DNA。样本量：m≥6μg；浓度：c≥30 ng/μL；纯度OD260/280≥1.8～2.0，OD260/230≥2.0
二、50ml新鲜培养菌液。
实验流程：
信息分析项目：
一、基本信息分析
按标准流程进行base calling、raw data数据整理及数据质量评估。
二、标准信息分析
1、基因组重测序分析
2、与参考基因组比对（共线性）
3、基因组岛鉴定
4、SNPs和InDel的检测及在基因组的分布
5、CNV和SV的检测及在基因组的分布
6、包含变异基因的COG和GO富集分析
7、包含变异基因的代谢途径分析（KEGG pathway）
三、根据客户需求进行个性化分析
普朗医疗是一家集研发、生产、销售、服务为一体的医疗企业，公司产品畅销海内外，广受好评！目前，普朗医疗与东南大学共同投资创办了南京普东兴生物科技有限公司，专业从事高通量基因测序仪及配套试剂的研发、生产和销售，并全方位的为客户提供数据分析和信息服务。产品主要应用于科学研究、个性化医疗健康、临床检测、生物生态分析等领域。目前，项目的测序核心技术及配套试剂已经成熟，并将于未来大规模产业化发展。全国免费咨询电话：400-6656-888。
希望你我的合作将共同搭建一个幸福的桥梁！
