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 Small RNA包含micro RNAs、siRNAs和 pi RNAs，是重要的生命活动调控因子，在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。通过对Small RNA进行高通量测序，能够对细胞或者组织中的全部Small RNA进行深度测序及定量分析。

        对Small RNA进行测序时，无需序列打断，直接分离制备cDNA文库，进行快速准确的高覆盖度测序，一次性获得数百万条单碱基分辨率的序列信息。Small RNA测序是siRNA分子挖掘，靶基因预测与鉴定，样品间差异表达分析的重要科研手段。
        应用技术手段：首先从Total RNA中分离出大小为18-30 nt的Small RNA，两端分别加上接头进行体外反转录成cDNA，利用测序仪对DNA片段进行深度测序。

 
图 Small RNA差异表达图

样本接收：
        一、Total RNA。样本量：m≥20 μg；浓度：c≥200ng/μL；纯度：OD260/280≥1.8～2.2，OD260/230≥2.0；完整性：RIN ≥ 8.0，28S:18S ≥1.5
        二、（1）新鲜动物组织（干重）：500mg～1g：（2）新鲜植物组织（干重）：1～2g；（3）新鲜培养细胞：3×106～5×106个；（4）全血：5ml以上；（5）菌液：50ml新鲜培养菌液

实验方案：

信息分析项目：
        一、标准信息分析
        1、数据产出统计，对原始测序数据去接头污染，去低质量reads；
        2、18~30 nt 小RNA 测序结果的长度分布；
        3、小RNA在选定的参考基因组上的分布；
        4、小RNA与rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的比对信息；
        5、小RNA与重复序列的比对信息；
        6、小RNA与miRBase 中指定范围的已知的 miRNA的比对；
        7、对没有注释的small RNA进行预测，预测新的miRNA；
        二、根据客户需求进行个性化分析

        南京普东兴生物科技有限公司是由国内知名医疗器械厂家普朗医疗和东南大学共同投资的一家高科技生物技术公司。公司有着强大的技术团队，汇聚了以长江学者，著名生物电子学家陆祖宏博士为核心的一大批业内专家。2010年，公司成功研发出具有自主知识产权的“AG-100”高通量测序仪，并与生物研究实验室合作，应用于实践领域。目前，项目的测序核心技术及配套试剂已经成熟。新一代“AG-200”高通量测序仪的研制也进入了中试阶段，预计未来1-2年将实现大规模产业化。
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