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优宁维之CRISPR-Cas9 基因敲除技术优势详解

来宝网 2015/6/12点击7661次

CRISPR-Cas9 基因敲除技术

Santa Cruz——中国正式授权代理商:优宁维 
CRISPR/Cas9 介绍的基因组编辑,定向双链断裂(DSB)

我们的优势:

★ 数量多,santacruz提供超过18,920种人和超过18,347种小鼠蛋白的特异性CRISPR/Cas9敲除质粒。
★ 特异性基因识别
★ 高效的基因敲除
★ 低细胞毒性
★ 设计简单快速,费用低
★ 每一个CRISPR/Cas9敲除质粒由3条质粒组合确保识别和剪切 特异性基因,获得最大敲除效果。
★ 每条质粒由来自GeCKO文库特有的20nt序列编码
★ 每一包装20µg,up to 20 transfections


★ Cas9/gRNA complex binds to proto-spacer adjacent motif(PAM)site and unwinds DNA.
★ gRNA binds to target locus in genomic DNA adjacent to the PAM site.
★ Cas9 cleaves the 5’exons of the gene targeted by the three gRNA plasmids at three specifics sites.
★ Target gene is disrupted.
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PARP-1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid(h):sc-400046.Western blot analysis of human PARP-1 expression in empty vector control(A) and PARP-1 CRISPR/Cas 9 KO Plasmid transfected(B) Hela whole cell lysates. Blot probed with PARP-1(B-10):sc-74470.α-actinin(H-2):sc-17829 used as specificity and loading control.

HDR(Homology Directed Repair) 修复更精准!

      HDR质粒提供用于特异DNA的双链断裂(DSB)修复的模板,比non-homologous end -joining(NHEJ)更精确,不用担心非特异性插入或者缺失裂解位点。
我们的产品:

每个HDR质粒由三条特异性裂解相应CRISPR/Cas9敲除质粒位点的质粒组成
每个HDR质粒由两条与基因组DNA特异性重组结合800bp的同源arms组成,围绕相应的Cas9引起的双链DNA断裂位点
每个HDR质粒插入一个嘌呤霉素抗性基因,选择已经发生了Cas9引起的DNA剪切的细胞
每个HDR质粒包含RFP蛋白,以便确认是否转染
每个嘌呤毒素抗性基因被两个LoxP位点侧接,以允许由Cre重组载体进行进一步的处理。Provided as transfection-ready,purified plasmid DNA
每个包装20µg,up to 20 transfections
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Cre VECTOR:sc-418923

该Cre重组载体表达Cre重组酶,噬菌体P1酶催化两个loxP序列之间的位点特异性DNA进行重组。
当CRISPR/Cas9敲除质粒和HDR质粒共转染后,在HDR修复过程中,含有编码DNA的细胞抗原被选择性插入的标记分离
选择中,细胞可以被Cre载体转染,在HDR修复中去除插入的基因组DNA,eg:嘌呤毒素抗性基因。
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CRISPR/Cas9 铺助试剂:
品名 货号 规格
Control CRISPR/Cas9 Plasmid sc-418922 20µg
Plasmid Transfection Reagent sc-108061 0.2ml
Plasmid Transfection Medium sc-108062 20ml
Puromuycin dihydrochloride sc-108071 25mg

常见问答(部分)

1.CRISPR/Cas9与RNAi技术相比有什么优势?   4.为什么CRISPR/Cas9基因敲除质粒要用三条靶DNA序列组成。
答:CRISPR/Cas9系统是用特异编码的基因组DNA敲除目的蛋白;而RNA干扰是用特异的mRNA降解的技术。一旦基因组DNA被编码,将是永久性的。   答:确保足够的基因被破坏,确保敲除效果。
2.和zinc-finger nucleases (ZFNs) and TALENs相比有什么优势?   5.CRISPR/ Cas9 KO质粒是否可以单独用于敲除基因的功能?
答:CRISPR/Cas9系统具有相同或者更高的基因编辑效率,更便宜。   答:可以,但是会产生非同源末端连接(NHEJ),导致InDels(插入/缺失)。InDels改变了开发阅读框并且能显著改变了下游的DSB的氨基酸序列,引起一个提前终止密码子。InDels可能导致随机突变,这样的基因破坏程度需要通过实验验证。
3.你们是如何设计gRNA序列的?可以提供序列吗?   6.我如何确认我的细胞成功转染了CRISPR/Cas9基因敲除质粒?
答:我们用3条已经在GeCKO v2 library发表的靶序列设计。这种发表的序列具有高修饰效率和低脱靶效应。当然gRNA的序列可以提供给客户,联系优宁维公司。   答:我们可以通过GFP的表达来验证转染效率。进一步的验证来确定基因敲除的程度。

References/参考文献

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2.Hsu, P., et al. 2014. Development and Applications of CRISPR-Cas9 for Genome Editing. Cell. 157(6):1262-78. PMID 24906146.   8.Gasuinas, G., et al. 2012. Cas9-crRNA Ribonucleoprotein Complex Mediates Specific DNA Cleavage for Adaptive Immunity in Bacteria. Proc. Natl. Acad. Sci. 109(39):E2579-86. PMID 22949671.
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5.Jinek, M., et al. 2012. A Programmable Dual-RNA Guided DNA Endonuclease in Adaptive Immunity. Science. 337(6096):816-21. PMID 22745249.   11.Shalem O., et al. 2014. Genome-scale CRISPR-Cas9 Knockout Screening in Human Cells. 343(6166):84-7. PMID 24336571.
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