如非指出,所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。 1. 将单一的目的DNA条带从琼脂糖凝胶中切下(尽量切除多余部分)放入干净的离心管中,称取重量。 2. 向胶块中加入3倍体积溶胶液PN (如果凝胶重为100mg,其体积可视为100 ul,则加入300 ul溶胶液),55℃水浴放置10分钟,其间不断温和地上下翻转离心管,以确保胶块充分溶解。 注意: a) 如果此时溶胶液变为粉红色,请加入少量3M NaAc pH5.2(一般说来,10μl足矣),使溶胶液变为黄色再上柱离心。 b) 对于高浓度的凝胶(>2%),按照100mg凝胶加入100μl灭菌水和600μl溶胶液PN的比例加入溶胶液PN。 c) 胶块完全溶解后最好将胶溶液温度降至室温再上柱,因为吸附柱在较高温度时结合DNA的能力较弱。 3. 当目的片段<500bp时,如想提高回收效率,向溶胶体系种加入1/3溶胶液PN体积的异丙醇(如使用300μl溶胶液,则加入100μl异丙醇),混匀,55℃温浴1分钟后再进行步骤4。当目的片段>500bp时,省略此步骤,直接进行步骤4。 4. 将上一步所得溶液加入到吸附柱CA1中(吸附柱放入收集管中),室温放置2分钟,13,000 rpm离心60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放入收集管中。 注意: a) 吸附柱CA1的有效容积为700μl,如溶胶体系体积大于700μl,分次上柱,保证全部溶液都加到吸附柱中。 b) <100bp和>10kb的片段请在室温放置10分钟,这将会提高回收效率。 5. 向吸附柱中加入700μl漂洗液PW(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),13,000 rpm离心60秒,倒掉废液,将吸附柱重新放入收集管中。 6. 向吸附柱中加入500μl漂洗液PW,13,000 rpm离心30-60秒,倒掉废液。 7. 将离心吸附柱CA1放回收集管中,13,000 rpm离心2分钟,尽量除去漂洗液。 注意:此步必不可少!如果漂洗液有残留会影响回收效率和DNA质量,进而影响下游实验;离心后将吸附柱盖子打开,室温放置2分钟,这样将有助于彻底挥发残余乙醇。 8. 将吸附柱放到一个干净离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加适量洗脱缓冲液EB(一般不要少于30μl),室温放置2分钟。13,000 rpm离心1分钟收集DNA溶液。 注意: a) 可将洗脱缓冲液EB预热到70℃后再加到吸附膜上,这样可以提高洗脱效率。 b) CA1柱的洗脱体积不应少于30 μl,体积过小将会降低回收效率。 c) 洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率 9. DNA产物-20℃保存。 |