Nature Genetics：迄今规模较大的罕见肿瘤基因研究完成

一国际研究小组研究发现，5种基因的常见变异会增加患神经胶质瘤的风险，从而确定某些遗传因素对该种疾病的产生发展具有重要作用。这个发现将有助于识别该肿瘤的易患群体，并为预防和治疗这类疾病提供潜在目标。研究成果发表于近期的《自然·遗传学》杂志网络版。

神经胶质瘤，包括星形细胞瘤、少突神经胶质瘤和多形性胶质母细胞瘤等，是一种常见的脑癌，在原发性恶性脑瘤中约占80%。美国每年大约有2.2万例新发病例和1.3万例死亡病例。

美国德克萨斯大学安德森癌症研究中心和英国肿瘤研究所的研究人员对1878名神经胶质瘤患者和3670名对照者基因组中的521571个单核苷酸多态性（SNPS）进行了分析，结果发现34个SNPS与神经胶质瘤有关。随后在德国、法国和瑞典进行的独立病例对照研究中，研究人员对这34个SNPS进行了涉及2545例神经胶质瘤病例和2973例比照病例的综合分析后，遴选出14个SNPS，这14个SNPS映射到基因组中的5个位点。

这5种基因分别是：位于8号染色体的CCDC26、位于5号染色体的TERT、位于9号染色体的CDKN2A、位于20号染色体的RTEL1以及位于11号染色体的PHLDB1。相比于没有这些基因变异的人来说，有这5种基因的最大变异者患有神经胶质瘤的风险分别增加了18%、24%、27%、28%和36%。研究人员还发现，这些基因的影响是相互独立的，因此，如果变异基因越多，患病风险就越大。这5种基因中有8个或更多达14个变异的人患有神经胶质瘤的风险是正常人的3倍。

这项研究是目前世界上针对罕见肿瘤所进行的规模最大的一次基因研究，其统计数据具有极高的可信度。尽管仅用这些基因变异情况来确定哪些是易患人群还为时过早，但这个发现仍令人鼓舞。这一成果使研究人员第一次拥有足够大的样本来了解与神经胶质瘤相关的遗传因素，从而为了解这些脑肿瘤可能的成因打开了一扇门，以对这种病进行更全面深入的研究。

对于这些基因变异如何影响其功能以及怎样促使神经胶质瘤产生发展仍有待进一步研究。因为该类疾病不仅仅是遗传性的，人口、行为和环境等因素都会对其产生影响，需要建立一个更全面的模型来确定危险人群。

研究人员将参与一个多中心研究项目，计划在2010年初对过去几年研究中发现的所有神经胶质瘤的潜在风险和保护性因素进行研究，如电离辐射、过敏、感染、使用非甾体抗炎药等，其样本数量高达1.2万个（6000名神经胶质瘤患者和6000名对照者）。

原始出处：

Nature Genetics 5 July 2009 | doi:10.1038/ng.407

Genome-wide association study identifies five susceptibility loci for glioma

Sanjay Shete1,17, Fay J Hosking2,17, Lindsay B Robertson2, Sara E Dobbins2, Marc Sanson3, Beatrice Malmer4, Matthias Simon5, Yannick Marie3, Blandine Boisselier3, Jean-Yves Delattre3, Khe Hoang-Xuan3, Soufiane El Hallani3, Ahmed Idbaih3, Diana Zelenika6, Ulrika Andersson4, Roger Henriksson4, A Tommy Bergenheim7, Maria Feychting8, Stefan L?nn9, Anders Ahlbom7, Johannes Schramm5, Michael Linnebank10, Kari Hemminki11, Rajiv Kumar11, Sarah J Hepworth12, Amy Price2, Georgina Armstrong1, Yanhong Liu1, Xiangjun Gu1, Robert Yu1, Ching Lau13, Minouk Schoemaker14, Kenneth Muir15, Anthony Swerdlow14, Mark Lathrop6,16, Melissa Bondy1 & Richard S Houlston2

To identify risk variants for glioma, we conducted a meta-analysis of two genome-wide association studies by genotyping 550K tagging SNPs in a total of 1,878 cases and 3,670 controls, with validation in three additional independent series totaling 2,545 cases and 2,953 controls. We identified five risk loci for glioma at 5p15.33 (rs2736100, TERT; P = 1.50 10-17), 8q24.21 (rs4295627, CCDC26; P = 2.34 10-18), 9p21.3 (rs4977756, CDKN2A-CDKN2B; P = 7.24 10-15), 20q13.33 (rs6010620, RTEL1; P = 2.52 10-12) and 11q23.3 (rs498872, PHLDB1; P = 1.07 10-8). These data show that common low-penetrance susceptibility alleles contribute to the risk of developing glioma and provide insight into disease causation of this primary brain tumor.

1 Department of Epidemiology, The University of Texas M.D. Anderson Cancer Center, Houston, Texas, USA.
2 Section of Cancer Genetics, Institute of Cancer Research, Sutton, Surrey, UK.
3 Service de Neurologie Mazarin et INSERM U 711, H?pital de la Salpêtrière 47, Paris, France.
4 Department of Radiation Sciences, Oncology, Ume? University, Ume?, Sweden.
5 Neurochirurgische Universit?tsklinik, Bonn, Germany.
6 Centre National de Génotypage, IG/CEA, Evry Cedex, France.
7 Department of Clinical Neuroscience, Ume? University, Ume?, Sweden.
8 Institute of Environmental Medicine, Karolinska Institutet, Sweden.
9 Department of Medical Epidemiology and Biostatistics, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
10 Department of Neurology, University Hospital Zurich, Zurich, Switzerland.
11 Division of Molecular Genetic Epidemiology, German Cancer Research Center (DKFZ), Im Neuenheimer Feld 580, Heidelberg, Germany.
12 Centre for Epidemiology and Biostatistics, Faculty of Medicine and Health, University of Leeds, Leeds, UK.
13 Texas Children's Cancer Center, Baylor College of Medicine, Houston, Texas, USA.
14 Section of Epidemiology, Institute of Cancer Research, Sutton, UK.
15 Division of Epidemiology and Public Health, University of Nottingham Medical School, Queen's Medical Centre, Nottingham, UK.
16 Foundation Jean Dausett-CEPH, Paris, France.
17 These authors contributed equally to this work.