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定量PCR仪的选购

互联网2008年3月10日 15:35 点击:3965

荧光定量PCR的历史:
荧光定量PCR是PCR的一种。PCR仪目的为了基因扩增。在基因扩增中最重要的就是升降温过程,最早的PCR就是三个水浴锅,一个机械臂,定时抓出反应槽转换水浴锅。PCR的结果需要借助其他手段来检测。后来随着定量技术的发展,将PCR和检测做成一体,就形成了定量PCR仪。由于应用的是荧光技术,同时在每个扩增过程都能实施监控,所以标准的叫法为实时荧光定量PCR仪。准确的讲实时荧光定量PCR没有自动加样和标本处理系统,只能算半自动的。PCR仪简单的讲,就是一个温控设备和一个检测设备。
荧光实时定量PCR技术最早是在1992年由一位日本人Higuchi第一次报告提出的,他当时想实时地看到PCR反应的整个过程,由于当时EB(溴化乙锭)的广泛使用,最直接想到的标记染料就是EB,可以插入到双链核酸中受激发光,在PCR反应的退火或延伸时检测掺入到双链核酸中EB的含量就能实时监控PCR反应的进程,考虑到PCR反应的数学函数关系,结合相应的算法,通过加入标准品的方法,就可以对待测样品中的目标基因进行准确定量。这样,在普通PCR仪的基础上再配备一个激发和检测的装置,第一台实时定量PCR仪就诞生了。
而真正市场化的美国应用生物系统公司自1996年推出荧光定量PCR仪,ABI公司一直标称其推出了全世界首台荧光定量PCR仪
目前市面上有多家品牌,主要有ABI、Roche、Bio-Rad和MJ

 

荧光定量PCR的技术
定量PCR技术自产生以来,不断发展完善,到目前为止已经非常成熟了。标记方法由最初单一的染料法,发展到了特异性更高的探针法,如Taqman、Molecular Beacon、Fret等不同方法的标记探针,其中由于Taqman探针的广泛使用,实时定量PCR的方法也称为Tagman法。
在过去很长一段时间里,由于PCR检测的灵敏性和不稳定性,容易产生假阳性,国家对这种检测方法在临床上的应用是禁止的。但是随着荧光定量PCR技术的发展成熟和完善,特别是Taqman方法的广泛使用,使得荧光定量PCR以一种新的PCR检测技术得以在在临床检测上使用,如对病毒、病菌及其它致病微生物,致病基因的检测。
Taqman探针法具有高适应性和可靠性,实验结果稳定重复性好;由引物、探针序列和引物探针相互作用关系的双重保证克服了普通PCR的缺陷,现在国家对这方面的限制正逐步解开,目前正在规范相应的法律法规,为荧光定量PCR技术在分子诊断中的广泛使用做准备工作。
最常用的有三种检测模式:
1、R Green I检测模式。
2、Taqman探针法
3、杂交探针

荧光定量检测技术的优势
相对于抗原抗体法检测具有以下优势:
1. 研发方便,设计探针和摸定反应条件可以在短时间内完成,顺利的话,只需几次反应和几天的工作量就可以完成一种检测方法的建立。而拿到一个好的抗体至少需要一个完整的免疫周期,还不考虑筛选获得一个高特异性、高滴度免疫株的成功几率。
2. 检测灵敏度高,是一个基于PCR的信号放大检测系统。
3. 可以准确定量。

荧光定量PCR的应用
荧光定量检测技术在临床诊断方面很多,主要集中在各种病原体引起疾病的临床诊断,如肝炎类疾病、性病、与优生优育相关的疾病以及肺结核等等。
荧光定量PCR的应用不仅限于临床检测,在基础研究和海关、食品卫生检疫方面的应用前景都相当广泛。
基础研究中,对某一样品中目标基因含量的测定需求是相当广泛的,荧光定量PCR技术具有操作方便、反应快速的特点,可以对一些微量样品进行检测。所以在新药开发、超早期感染用药物及疗法的研究与开发、药物疗法研究、新诊断及检验试剂的开发、血液检验漏检率等方面,荧光定量PC技术有着广泛的应用前景。
在海关卫生检疫方面,进口的粮食、食品、花果是否安全,是否含有危险或潜在危险的成分,都可以用荧光定量PCR技术进行检测。一些瘟疫流行地区进口的相关食品也需要进行检测,比如前一段时间,欧洲流行疯牛病,日本流行猪口蹄疫,那么从这些地区进口相应的肉品及肉类加工产品,就要进行食品卫生检疫
在食品卫生检疫方面,如转基因食品,由于其是否安全目前尚无定论,因此有些国家明确规定转基因食品需要标签标识区分,我国也正在出台类似的法律法规。
此外一些生物类的恐怖袭击等,都可以用荧光定量PCR的方法进行快速检测。
所以荧光定量PCR最明显的对象主要是医院的检验科、中心实验室、临检中心、地方的疾病控制中心、生物技术公司、血液制品相关的部门。当然科研院所、学校是少不了的。

市场竞争情况:

现在国内国外荧光定量PCR仪的品牌不是很多,国内外品牌及产品代理商一览(见表一)
ABI美国应用生物公司:老牌的生物公司贵族,荧光定量PCR仪有四种型号的。其中5700、7700已停产;现在剩Prism® 7000荧光定量PCR仪、Prism® 7900高通量荧光定量PCR仪。ABI在中国有自己的办事处和销售人员。由于ABI是生物仪器的著名品牌,同时在产品推广方面有独到之处,所以其产品的销路一直很好。
ROCHE罗氏诊断:单一产品LightCycler,以科研定位为主。其很特色离心、气加热、毛细管等,设计另类,是最有特色的PCR仪。
罗氏其很多产品如诊断试剂,都进入医院,与医院的关系密切,在国内很多医院使用,市场做得很不错。
MJ Research:实时荧光PCR仪刚进入中国不久,孔间能使用不同温度是其特色。,其MJ Research在北京设立了办事处,其DNA Engine Opticon产品于2003年4月2日获得国家食品药品监督管理局的医疗器械准入证。
该公司系列产品早先是由基因公司代理,市场销售十分火爆,于2003年起正式由东胜公司独家代理。MJ的扩增仪在生命科研领域比较出名,加之东胜公司的擅长在学校和科研院所的推广,所以其荧光定量PCR在以实验为主体的研究领域占有重要地位。
伯乐: iCycler是其主打,进入中国已经比较久了,产品和5700一样,是扩增仪上加装定量模块而成,特点是价格较低。

生产商 型号 参考报价 代理销售商
美国应用生物系统公司 PRISM 7900高通量型 美国应用生物系统公司(上海)

7000型
瑞士罗氏诊断 LightCycler US$88,000 罗氏诊断产品(上海)有限公司
美国MJ Research公司 Opticon 东胜创新生物科技科技有限公司

Opticon2多色荧光
美国Bio-Rad iCycler iQ 伯乐分析生化仪器有限公司(上海)
美国Stratagene Mx3000P 安莱公司

Mx4000
Corbett Roter Cene-3000 基因公司
美国Cepheid公司 SmartCycler US$38000 上海皓嘉科技发展有限公司

英国HYBAID 不祥 广州三元科技有限公司

日本BIOER 齐全 上海华耀贸易有限公司

上海枫岭生物技术公司 FTC2000 上海枫岭生物技术公司
厦门安普利生物工程有限公司 FluoScan 9700 厦门安普利生物工程有限公司

杭州博日科技有限公司 FQD-33A ¥428,000 杭州博日科技有限公司

深圳Hema公司 Hema荧光定量PCR ¥98,000 深圳Hema公司
表一

荧光定量PCR仪技术指标比较
荧光定量PCR简单讲即温控设备pcr和荧光检测系统、计算机及软件系统。
关于温控,包括温度的均一性、升降温速度。主要是介质问题。理想的介质是要求导热性好、比热大、接触紧密。
水浴和油浴:温控的首选,比热大(油比水更大)、与反应物无缝接触,效果当然最好。
缺点不能自动化、小型化,只有最初的水浴锅式使用。
硅加热:Peltier这是使用最普遍的一种,优点:易自动化、速度快、直接加热降温,效果当然好,
缺点1、成本较高;
2、第二其使用的介质是金属,导热虽然好,但是与反应管,很难做到无缝接触,定性时代可以加油,但用荧光定量,由于油有荧光信号不能用。所以在无缝接触上差一些。
空气加热:与反应体系无缝接触
缺点:空气的导热性差、比热小的弱点明显。因此空气加热的要利用离心来产生空气流动,增强导热性,同时使用毛细管,加大接触面积、试剂微量化来弥补。这样做了以后效果还是不错。
同时,使用离心,对标本量增大是有影响的,并且标本量越大,空气比热小的弱点就越明显,所以空气加热的仪器标本量都比较小。使用毛细管后由于反应液与管的接触面积增大,吸附现象更大,因此试剂的通用性差,一般要专门开发,成本高,虽然试剂用量少,但因为是专用试剂,每人份就是以实际量算,并不省试剂。反而增加了毛细管成本。
关于功能,所有的PCR仪功能都大体相同。只有MJ孔间能使用不同温度比较独特,这对于多项目同时检测以及循环参数的调整比较有用。但其实时荧光的仪器刚进入中国不久,

所以这样就可以把市面上的产品分两类,半导体Peltier和空气。
表一7家公司产品,其中罗氏的LightCycler和Corbert的RotorGene是用空气加热,其余是Peltier
当然加热还有电热丝+半导体,致冷还有压缩机
空气的加热的标本量为32/批,其他96/批,iCycler 能达到384/批,这也难怪,是扩增仪上加装定量模块而成,所以如果标本量大,建议不要用罗氏。一则会累死的。同时每个标本要分摊的标准曲线,对照成本太高,试剂也比较受限。

监测系统:
光源,钨灯、激光、发光二极管
检测器:摄像头、光电二极管、光电倍增管PMT
型号 激发光源 检测器
PRISM 7

(来源: 互联网 )


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