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PCR技术攻略,必须了解一下

武汉艾美捷科技有限公司2019年11月25日 17:09 点击:1265

聚合酶链式反应(PCR)是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA复制,PCR的最大特点是能将微量的DNA大幅增加。因此,无论是化石中的古生物、历史人物的残骸,还是几十年前凶杀案中凶手所遗留的毛发、皮肤或血液,只要能分离出一丁点的DNA,就能用PCR加以放大,进行比对。

这也是“微量证据”的威力之所在。由1983年美国Mullis首先提出设想,1985年由其发明了聚合酶链反应,即简易DNA扩增法,意味着PCR技术的真正诞生。到如今2013年,PCR已发展到第三代技术。1976年,中国科学家钱嘉韵,发现了稳定的Taq DNA聚合酶,为PCR技术发展也做出了基础性贡献。

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§ 终点PCR(End point PCR,PCR)

顾名思义既是对PCR扩增反应的终产物进行定性及定量分析,因为其在反应过程中无法监测反应进行情况,只有反应完成后通过跑胶得到结果,也称常规PCR。通常在常规PCR反应中,反应体系各成分是一次性加入并进入循环,极易发生引物错配和二聚体的形成,继而导致非特异性产物的扩增。而升级后的热启动PCR技术可以有效地解决这一问题,热启动通过各种物理化学方法控制PCR的必须成分,通常是DNA聚合酶,直到反应混合物被加热到可以阻止非特异性引导和引物聚合的温度后,再启动PCR来达到有效扩增特异性PCR产物的目的。

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热启动PCR酶:5x HOT FIREPol Blend Master Mix RTL 12.5 mM with BSA,货号:04-25-00S25

§ 定量PCR(Quantitative PCR, Q-PCR)

通过对PCR扩增反应中的每一个循环产物荧光信号的实时监测从而实现对其实模板的定性及定量分析。目前它主要通过两种方式——荧光染料或者荧光标记的探针对PCR产物进行标记跟踪,实时在线监控反应过程,并结合相应的软件对产物进行分析,计算待测样品模板的初始浓度。

荧光染料:在传统PCR反应体系中,加入过量荧光染料,该染料只与双链DNA小沟结合的染料,并不与单链DNA链结合,而且在游离状态不发出荧光,只有掺入DNA双链中才可以发光,因此,在PCR体系中,随着特异性PCR产物的指数扩增,每个循环的延伸阶段,染料掺入双链DNA中,其荧光信号强度与PCR产物的数量呈正相关。下图以SYBR Green I染料为例:

探针法:PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。再通过实时监测整个PCR进程荧光信号的积累,与标准曲线对比进行定量分析。下图以TaqMan探针为例:

§ 反转录PCR(Reverse TranscriptionPCR, RT-PCR)

RT-PCR是一种将cDNA合成与PCR技术结合分析基因表达的快速灵敏的方法,主要用于对表达信息进行检测或定量分析。在实际应用中,RT—PCR又常常分为一步法RT-PCR和两步法RT-PCR。

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(来源: 武汉艾美捷科技有限公司


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