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组蛋白修饰—组蛋白乙酰化解决方案

http://www.amyjet.com/featured/hats.shtml2020年12月22日 3:48 点击:1196

 

一、组蛋白乙酰化作用

 

越来越多的证据表明:组蛋白乙酰化在转录调控中的作用机制表现为:①组蛋白尾部乙酰基的加入,中和了组蛋白的电荷,弱化了组蛋白与DNA的相互作用,疏松了染色质结构,有利于转录的进行,②组蛋白的乙酰化可以为转录因子的招募提供特异性的锚定位点:③组蛋白乙酰化结合其他组蛋白修饰(甲基化,磷酸化、泛素化)形成组蛋白密码影响基因的转录。

 

二、组蛋白乙酰化修饰

 

蛋白乙酰化:在乙酰基转移酶的作用下,在蛋白质赖氨酸残基上添加乙酰基的过程。

 

组蛋白乙酰化:是一种翻译后修饰,多发生在核心组蛋白N一端碱性氨基酸集中区的特定赖氨酸残基,将乙酰辅酶A的乙酰基转移到赖氨酸的sNH3+中和掉1个正电荷。由组蛋白乙酰转移酶(HATs)和组蛋白去乙酰基转移酶(histone deacetylase,HDACs)共同决定。

 

重要性:通过研究组蛋白乙酰化和组蛋白脱乙酰化,研究人员可以对“组蛋白密码”有更多的了解,可以研发HDAC的药物,组蛋白脱乙酰基酶抑制剂(HDACi)通常用作情绪稳定剂和抗癫痫药,最近已被用作可能的癌症,神经退行性疾病和炎性疾病的治疗方法。

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三、组蛋白乙酰化相关研究工具

 

1.组蛋白提取试剂盒

在我们进行某项实验之前首先需要做很多的准备工作,比如组蛋白修饰实验,需要准备的是组蛋白。那么我们怎么来准备适合我们实验需要的组蛋白呢?取决于你用的提取试剂盒。比如OP-0006 EpiQuik Total Histone Extraction Kit(100):

 

适合从哺乳动物的细胞或者组织中提取总核心组蛋白(H2A, H2B, H3, and H4),组蛋白提取物中的翻译后修饰(PTM)保持完整,因此可与Epigentek的组蛋白修饰测定试剂盒一起使用,或用于组蛋白甲基化,乙酰化,磷酸化,SUMO化,泛素化,瓜氨酸化和ADP-核糖基化研究。

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2.组蛋白乙酰化定量试剂盒

组蛋白乙酰化,包括组蛋白H3和组蛋白H4,参与染色质结构的调节和转录因子向基因启动子的募集。量化乙酰化组蛋白的总水平或特定赖氨酸的水平将有助于阐明基因激活的表观遗传调控,并有助于开发针对HAT或HDAC的药物。

 

p-4030,总乙酰化组蛋白H3快速检测试剂盒(比色法)能够检测总体乙酰化组蛋白H3的状态,操作便捷,快速稳定,比别的方法更优越安全.本试剂盒提供了进行检测实验所需的一整套试剂和方法,即时可用.EpiQuik总乙酰化组蛋白H3定量分析试剂盒(比色法)专门用来检测包括新鲜和冷冻组织、贴壁培养细胞以及细胞悬浮液在内各种哺乳动物细胞(人类、鼠类等)总体乙酰化的组蛋白H3.

 

还有H3K9,H3K14,H3K18,H3K36,H3K56,H4K5,H4K8,H4K16,H4K12,这些均有荧光法和比色法的定量检测试剂盒。

 

3.组蛋白乙酰转移酶(HAT)测定

组蛋白乙酰基转移酶(HAT)是在基因的转录调节中起关键作用的酶,通过选择性地乙酰化位于核心组蛋白蛋白质氨基末端附近的赖氨酸的ε-氨基而直接对应于转录。确定HAT的活性及其抑制剂的功效有助于发现药物和开发抗癌药,以及更好地理解基因转录。

 

P-4003HAT活性/抑制分析试剂盒(48次分析)用于测量总的组蛋白乙酰转移酶活性或抑制率,活性HAT与组蛋白底物结合并使其乙酰化。输入样本为核提取物或者纯化的酶,核提取物可搭配核提取试剂盒(op-0002或者op-0022)。可以用高亲和力的抗乙酰化组蛋白抗体识别乙酰化底物。 直接与HAT酶活性成正比的乙酰化组蛋白的比例或数量可以通过ELISA样反应进行比色定量。

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4.组蛋白脱乙酰基酶(HDAC)测定

组蛋白脱乙酰基酶(HDAC),也称为赖氨酸脱乙酰基酶(KDAC),是一类从核心组蛋白(H2A,H2B,H3和H4)除去乙酰基从而调节基因表达的酶。通过研究HDAC的活性和抑制作用,研究人员可以更好地了解组蛋白脱乙酰基对疾病和各种细胞过程的影响。

 

P-4034,组蛋白去乙酰化酶HDAC活性/抑制直接分析试剂盒(比色法)包含所有必要试剂,用来检测HDAC活性/抑制,在实验里,乙酰化的组蛋白HDAC底物稳定的包被在微孔板内,激活的HDACs绑定底物转移乙酰基团,HDAC去乙酰化产物被特异抗体所识别.比率或者大量去乙酰化产物被酶标仪在450nm处检测结果.HDAC酶活性与测得光密度值成比例.

 

参考文献:

Chelladurai P et. al. (July 2020). Isoform-specific characterization of class I histone deacetylases and their therapeutic modulation in pulmonary hypertension.Sci Rep. 10(1):12864.

Pasquereau S et. al. (July 2020). Impact of glucocorticoids on systemic sirtuin 1 expression and activity in rats with adjuvant-induced arthritis. Epigenetics. :1-12.

 

 


(来源: http://www.amyjet.com/featured/hats.shtml


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